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La expedición realizó muestreos en 34 estaciones entre 0 y 42 m de profundidad, distribuidas en los cinco ecosistemas estratégicos del área: manglar, litoral rocoso, planos lodosos intermareales, arrecifes rocosos, y ambiente pelágico. Las observaciones y el análisis de especímenes muestreados fueron realizados por expertos de cada grupo, quienes los identificaron hasta la categoría taxonómica más baja posible, más de 500 morfoespecies; pertenecientes a 10 fila de invertebrados (anélidos, artrópodos, brachiópodos, briozoos, quetognatos, cnidarios, equinodermos, moluscos, poríferos, platelmintos), 2 fila de cromistas (foraminíferos, ocrófitas), 3 fila de plantas (clorófitas, rodófitas, traqueófitas), y 2 subfila de vertebrados (que incluyen tunicados, peces condrictios y osteictios, aves, reptiles, y mamíferos). Este recurso recopila 2107 registros correspondientes a las observaciones, avistamientos y recolecta de ejemplares realizadas durante la expedición; de los cuales, 1633 registros se encuentran identificados hasta nivel de especie, 321 hasta género, 100 hasta familia, y 50 en categorías superiores. 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Biodiversidad marina encontrada durante la expedición Colombia BIO Juradó-Cupica, departamento del Chocó, Pacífico norte colombiano - Proyecto Colombia BIO. Version 2.5. Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras - Invemar. 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Serie Publicaciones Generales Nº 116 de INVEMAR, Santa Marta, Colombia, 318 pp. [ISBN 978-958-8935-65-2] https://doi.org/https://n2t.net/ark:/81239/m9x11f","citationProvidedBySource":false},{"text":"Lizarazo Rodíguez N, Zea S, Chasqui Velasco L, y Rincón Díaz N (2020) Biodiversidad de esponjas en arrecifes rocosos del Chocó norte, Pacífico Colombiano. Bol. Investig. Mar. Costeras; 49 (2): 79 – 130.","citationProvidedBySource":false},{"text":"Mejía-Quintero, K y Chasqui, L. (2020). Diversidad de corales en los riscales y morros del Pacífico norte Chocoano (Anthozoa: Hexacorallia y octocorallia). pp 118-157. En: Chasqui, L. (Ed.). Biodiversidad de los arrecifes rocosos(riscales y morros) del Pacífico Norte Chocoano. Serie Publicaciones GeneralesNo 116 de invemar. Santa Marta, Colombia. 318 p. 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Para Animales, 11 phyla de invertebrados: Annelida, Arthropoda, Brachiopoda, Bryozoa, Chaetognatha, Cnidaria, Echinodermata, Mollusca, Nemertea, Platyhelminthes, Porifera. 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registros corresponden a observaciones, avistamientos y recolectas de fauna y flora tomadas en los ecosistemas de manglar, litoral rocoso, planos lodosos intermareales, arrecifes rocosos y ambiente pelágico, localizadas entre el corregimiento de Cupica y el municipio de Juradó en el departamento del Chocó, Pacifico norte colombiano.\n\nEl área de interés cubre la porción norte del departamento del Chocó en el Pacífico colombiano, se extiende desde bahía Cupica al sur (6°38’07.19’’N; 77°27’18,64’’O), hasta el corregimiento de Curiché al norte (7°01’25,55’’ N; 77°43’09,86’’ O). Esta se encuentra dentro de la jurisdicción del Colectivo del Consejo Comunitario General “Los Delfines” (CCG Los Delfines) y el Consejo Comunitario de Cupica, el cual incluye los municipios de Juradó y Bahía Solano con sede en el Golfo de Cupica. En el área se establecieron 32 sitios de muestreo así: (1) Sector de Juradó: Bahía Humbolt, Cabo Marzo, Caladero La Parguera, Cambura, El Acuario, Manglares de Cupica, Morro Humboldt, Playa Aguacate, Playa Castellano, Playa Fondeadero, Playa Piña, Punta Boquete, Punta Cruces, Punta Melo, Punta Piña, Riscal La Foca, Riscal La Mina, Riscal La Viuda, Riscal Piedra de Eroito, Riscal Piedra de Rodrigo, Riscal Sueste. (2) Sector Bahía Solano: Bahía de Cupica, Chicocora, Manglares Resaca, Playa Resaca, Riscal Chicocora.\n\nEl conjunto de datos también incorpora registros biológicos obtenidos fuera del área directa de interés, que fueron obtenidos en particular para avistamientos de aves y mamíferos durante el desplazamiento desde el Puerto de Buenaventura hacia el área de muestreo, lo cual amplia hacia el sur la cobertura geográfica general de los datos reportados (3.91474,-77.43464).","boundingBox":{"minLatitude":3.91474,"maxLatitude":6.99124,"minLongitude":-77.72632,"maxLongitude":-77.42449,"globalCoverage":false}}],"temporalCoverages":[{"@type":"range","start":"2024-06-28T00:00:00.000+00:00","end":"2024-08-10T00:00:00.000+00:00"}],"keywordCollections":[{"thesaurus":"GBIF Dataset Type Vocabulary: http://rs.gbif.org/vocabulary/gbif/dataset_type_2015-07-10.xml","keywords":["Occurrence"]},{"thesaurus":"GBIF Dataset Subtype Vocabulary: 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Cofinanciación Proyecto \"Investigación para la generación y la democratización del conocimiento orientado a generar justicia ambiental, resilencia climática, desarrollo sostenible y ordenamiento de los territorios marinos y costeros de interés Nacional\" Código BPIN 202300000000039.","awards":[],"studyAreaDescription":"Este estudio se centró en una zona situada en el norte del departamento del Chocó, que se extiende desde Punta de Chicocora, al sur de bahía Cupica, hasta la bahía de Humboldt, frente a Juradó. Esta región se describe como una zona de vida de bosque muy húmedo tropical (Bmh-T) dentro de la zona de calmas ecuatoriales. El clima está influenciado por la Zona de Convergencia Intertropical (ZCIT), generando circulaciones locales y lluvias intensas, principalmente acentuadas por condiciones orográficas. La temperatura media varía entre 25-26.8 °C en las partes bajas (zonas costeras y bajamar) y entre 18.6-19.8 °C en las zonas altas (>100 msnm). La región Pacífico norte chocoano es una de las más lluviosas del mundo, con precipitaciones anuales superiores a 10.000 mm en algunas áreas, y un promedio de 6.000 mm/año. El patrón de lluvias muestra dos temporadas: lluvias altas en el primer semestre y lluvias bajas entre octubre y noviembre, alcanzando incluso los 250 días lluviosos al año (3 de cada 4 días). La región no tiene una temporada seca, pero experimenta una época de menor precipitación de diciembre a abril. Los principales afluentes en la Región norte, jurisdicción de Juradó son: ríos Cupica, Octávida, Curiche, Putama, Partadó y Juradó. Además, la escorrentía de las laderas de la serranía que caen sobre el litoral, origina numerosos cursos de agua independientes que desembocan directamente al mar. Estas microcuencas y cuencas transportan un flujo considerable de agua, trayendo sedimentos que son depositados en las zonas costeras, influyendo en la conformación del litoral y del fondo marino.","designDescription":"La caracterización biológica de los ecosistemas estratégicos se realizó a través de la Expedición BIO Juradó-Cupica de  la cua formaron parte 14 expedicionarios, distribuidos así: 6 investigadores del INVEMAR, 6 investigadores de la Universidad del Valle, 2 investigadores de la Universidad Tecnológica del Chocó. Además, contó con la participación de 16 personas pertenecientes a los Concejos Comunitarios locales de Curiché-Coredó, Cabo Marzo, Punta Piñas y Cupica, quienes participaron diariamente para realizar los distintos tipos de muestreos planeados para cada ecosistema estratégico, brindando además sus servicios de guías locales, transporte, y logística en el área de trabajo. La expedición se llevó a cabo entre el 27 de Julio y 11 de agosto del 2024, con una duración de 15 días, 12 días efectivos en campo y 4 días de tránsito. Durante este tiempo, se realizaron los muestreos de fauna y flora necesarios, para generar los inventarios taxonómicos de los principales grupos biológicos, asociados a cinco (5) ecosistemas marinos estratégicos que confluyen en la zona de Juradó y Cupica. Para cada uno de los ecosistemas se aplicaron las metodologías específicas que permitieran la obtención de los especímenes o el registro de la presencia con miras a construir los inventarios biológicos. El proceso de identificación se realizó utilizando metodologías basadas en la identificación morfológica tradicional, el análisis molecular mediante la técnica de código de barras del ADN (Barcoding) y el uso de bases de datos y catálogos regionales.","relatedProjects":[],"abstract":"La zona marina y costera del departamento del Chocó hace parte del litoral Pacífico norte, una región biogeográfica reconocida como un “hostpot” de biodiversidad, donde el conocimiento científico de su fauna y flora terrestre, ha sido sujeto de múltiples estudios desde hace cuatro décadas, lo que permitió considerar la región entre los 25 centros más importantes de biodiversidad y endemismo del planeta. Sin embargo, en el Pacífico norte chocoano el desarrollo de investigación científica enfocada al conocimiento de la biodiversidad marina ha sido escasa, limitándose a sectores puntuales como Punta Cruces y Cabo Marzo. En este contexto, el proyecto se propuso generar conocimiento sobre la biodiversidad en ecosistemas estratégicos de un área marina y costera, en jurisdicción de los municipios de Juradó y Bahía Cupica (Chocó) en el Pacífico norte colombiano. Para alcanzar el objetivo, el proyecto llevó a cabo la Expedición BIO JURADÓ-CUPICA, mediante la cual se recolectaron muestras de fauna y flora locales, para generar un inventario taxonómico de especies de los grupos biológicos principales, asociadas a los ecosistemas de arrecife rocoso (riscales), litoral rocoso, manglar, planos lodosos intermareales y pelágico. La expedición contribuirá al fortalecimiento de las colecciones biológicas y de los sistemas de información de biodiversidad de libre acceso (SIBM OBIS Colombia - Nodo marino del SiB Colombia, BOLD Systems), mediante la generación de registros biológicos y secuencias de ADN, como instrumentos para el avance de la investigación y la gestión de las comunidades locales. De igual forma, un segundo objetivo del proyecto buscó fomentar capacidades y apropiación social del conocimiento por parte de las comunidades e instituciones locales, a través de la generación de espacios de co-creación activa, con el fin de consolidar estrategias para contribuir al ordenamiento territorial alrededor del agua, con énfasis en el recurso pesca. Con este conocimiento se espera llenar vacíos de información, que permitirán el planteamiento de estrategias de conservación que impactarán la biodiversidad de la región."},"samplingDescription":{"studyExtent":"En la zona costera del Pacífico norte chocoano, los ecosistemas marinos y costeros están representados por cinco ambientes principales: \n\n(1) Manglar: se encuentran en los litorales de las zonas tropicales y parte de las zonas subtropicales del planeta. Estos árboles crecen en suelos planos y fangosos, que pueden estar permanentemente inundados o solo durante las mareas altas. Se localizan en zonas estuarinas, bahías, ensenadas, lagunas costeras, y esteros, entre otros, donde reciben aportes de aguas de escorrentía continental y están influenciados por aguas marinas o salobres. Los bosques de manglar se distribuyen de manera irregular, y se encuentran especialmente cerca de las bocanas de los ríos principales y en el interior de las ensenadas, donde la mezcla de aguas dulces y marinas favorece el crecimiento de los árboles de mangle. A estos ambientes, llegan a reproducirse, protegerse y alimentarse, gran cantidad de peces, aves e invertebrados. Además se destaca su importancia, al brindar protección de la erosión costera a los centros poblados adyacentes. La zona norte cerca del municipio de Juradó, posee una gran mancha de manglar ubicada al centro norte de la municipalidad, entre Curiche y Partadó, manchas medianas en el Estero Cacique y Punta Ardita, y manchas incipientes en Aguacate, Coredó, y las quebradas El Coco y Guarín. En total, Juradó aporta las 2237.1 hectáreas al ecosistema de manglar de la costa Pacífica chocoana, lo que corresponde apenas a un 5.4 %.\n\n(2) Litoral rocoso: formaciones costeras divididas en zonas infra, meso y supralitorales. Están compuestas por rocas no consolidadas de consistencia blanda como arcillas y limolitas, así como rocas masivas de consistencia dura como basaltos y granito; junto con fragmentos líticos de diferentes tamaños y orígenes, como cantos rodados, gravas y bloques. Estos litorales presentan pendientes fuertes a escarpadas y albergan comunidades de organismos sésiles endobentónicos, como bivalvos, equinodermos y poliquetos perforadores, que contribuyen a la erosión del material sedimentario. Además, se encuentran comunidades epibentónicas distribuidas en zonas verticales más o menos definidas, y pozos de marea con comunidades particulares de algas, poliquetos, equinodermos, crustáceos, moluscos y peces.\n\n(3) Planos lodosos intermareales: los sedimentos finos forman áreas litorales que quedan emergidas durante la bajamar. Estas áreas suelen encontrarse en zonas con poca a moderada energía o exposición al oleaje, especialmente en zonas deltaicas donde se depositan sedimentos transportados por los ríos. Debido a esto, están sujetas a cambios constantes ocasionados por la dinámica de deposición y erosión de sedimentos, y al régimen de las corrientes. Estas áreas tienen una pendiente muy suave y sirven como lugares de descanso y alimentación para aves migratorias y playeras. En el área de interés, estos planos lodosos se concentran principalmente en los golfos de Tribugá y Cupica, albergando una rica fauna de invertebrados y peces demersales. \n\n(4) Arrecifes rocosos o Riscales: formaciones rocosas sumergidas y emergidas e islas no deltaicas, de tamaño inferior a 60 hectáreas, también conocidos como \"islotes rocosos\", se encuentran cerca de la costa y son reconocidos por ornitólogos debido a su relevancia en la conservación de colonias migratorias de gaviotas, petreles, pelícanos y otras aves marinas. Estos lugares fueron seleccionados como objeto de conservación, como sustitutos para compensar la falta de información sobre sitios de anidación de aves marinas. En sus zonas sumergidas, son fundamentales para la vida marina y sustentan comunidades de peces, algas, esponjas y numerosos invertebrados; así mismo son importantes para los pescadores artesanales de la región, ya que son el sustento de especies de importancia comercial como pargos, meros y atunes. Estos riscales también funcionan como agregadores de peces distribuidos a lo largo de la costa, siendo más abundantes en zonas salientes de la costa como Cabo Marzo y Cabo Corrientes. Cabe mencionar que asociados en estos arrecifes rocosos, se encuentran algunas formaciones coralinas pequeñas, destacándose el arrecife de La Chola en la ensenada de Utría y el arrecife de Punta Tebada en el Golfo de Cupica. Además, se conocen pequeñas agregaciones de corales escleractínios en otros sectores como El Acuario (Cabo Marzo), Piñas (Punta Cruces) y Becerra (Bahía Solano).\n\n(5) Ambiente pelágico: corresponde a la columna de agua que se encuentra sobre el fondo marino, que incluye la zona nerítica ubicada sobre la plataforma continental con una profundidad máxima de 200 m, y la zona oceánica desde el borde de la plataforma continental hacia mar afuera. Las especies pelágicas que viven en aguas medias o cerca de superficie, limitan al máximo en contacto con el fondo marino y la costa, clasificándose de dos maneras, necton (capaces de desplazarse por sus medios sin importan las corrientes como peces, tortugas, mamíferos marinos, calamares y pulpos) y plancton (organismos que no pueden vencer las corrientes marinas, pueden ser vegetales o animales).","sampling":"Los ecosistemas y sitios estratégicos se seleccionaron mediante consultas entre científicos y los consejos locales, teniendo en cuenta los conocimientos tradicionales, la ubicación, las características naturales y la representatividad del paisaje. A partir de ello, se seleccionaron: manglares, litoral rocoso, planos lodosos intermareales, arrecifes rocosos y entornos pelágicos. El muestreo implicó una búsqueda, registro y recolección intensiva de especímenes. Los muestreos se realizaron en 34 estaciones distribuidas de la siguiente manera: en el municipio de Bahía Solano, 6 estaciones con 6 sitios de muestreo; y en el  municipio de Juradó, 28 estaciones con 23 sitios de muestreo. Los muestreos fueron planificados por ecosistema dependiendo de las condiciones de marea, realizándose mayoritariamente en marea baja, y definiéndose para cada uno los métodos, tiempos y equipos requeridos (caminata, buceo a pulmón, buceo autónomo, u observación de punto fijo. Para la obtención de los datos se tuvo la siguiente organización: \n1. Preparación y planeación para los diferentes componentes a muestrear.\n2. Muestreos en ecosistemas estratégicos: a. Manglar; b. Litoral rocoso; c. Planos lodosos intermareales; d. Arrecife rocoso (riscal); e. Ambiente Pelágico.\n3. Separación, fijación, preservación y etiquetado de los especímenes y muestras.\n4. Identificación taxonómica: análisis morfológico y molecular.\n5. Validación de expertos. \n6. Estructuración de datos e información.\n7. Preparación y sistematización de metadatos en IPT.\n8. Documentación en BoldSystems.\n9. Controles de calidad de datos.\n10. Publicación del recurso en OBIS y GBIF.\n11. Depósito en colecciones científicas.","qualityControl":"1. Durante el trabajo en campo: se asignó un líder experto en cada uno de los ecosistemas visitados, quien se encargó de mantener los métodos de recolecta, fijación y asignación de códigos para etiquetado conforme los estándares metodológicos establecidos. Para garantizar la calidad y la trazabilidad de la información, se asignaron códigos durante el proceso de etiquetado. Estos códigos incluían información sobre el área de muestreo, el ecosistema de origen, el número de campo de la estación visitada, la letra inicial del phylum al que pertenecía la muestra, un número consecutivo único dentro del grupo taxonómico, y la fecha de recolecta. Las muestras codificadas se listaron en tablas de Excel y se verificaron comparando la información con las muestras físicas. Este proceso se llevó a cabo para evitar la duplicación de datos e identificar discrepancias que pudieran afectar a su calidad. \n2. Durante el procesamiento: los organismos fueron identificados por expertos en la taxonomía de cada grupo biológico con el apoyo de análisis moleculares, utilizando un enfoque integrador. Las clasificaciones taxonómicas y las autoridades se asignaron de acuerdo con el catálogo del Registro Mundial de Especies Marinas (WoRMS). \n3. Durante la documentación y preparación de los datos: Las tablas de datos se estructuraron de acuerdo con las directrices del estándar Darwin Core (DwC) para datos de ocurrencias utilizados por el Sistema de Información sobre la Biodiversidad Oceánica (OBIS), el Sistema de Información sobre la Biodiversidad de Colombia (SiB Colombia) y la Infraestructura Mundial de Información sobre Biodiversidad (GBIF). Asimismo se siguieron los requisitos específicos de la plataforma BOLDSystems al introducir las secuencias de los especímenes y documentar sus respectivos metadatos.  El conjunto de datos se validó de nuevo durante el proceso de publicación a través del Integrated Publishing Toolkit (IPT) por parte del nodo colombiano de OBIS.\n4. Durante el proceso de publicación del IPT, el nodo OBIS Colombia realizó primero la verificación teniendo en cuenta: (a) criterios curatoriales (verificación física de lotes e información); (b) criterios taxonómicos (validaciones taxonómicas); (c) criterios espaciales (validaciones de georreferenciación); y (d) criterios documentales. A continuación, se validó la estandarización utilizando diferentes herramientas. Luego, realizó una doble verificación basada en los indicadores de calidad establecidos para garantizar el cumplimiento de los requisitos del OBIS, el SiB Colombia y GBIF, que se basan en el Estándar Darwin Core. Del mismo modo, se validó la integridad de los metadatos documentados teniendo en cuenta las directrices del Estándar de Lenguaje de Metadatos Ecológicos (EML). El conjunto de datos se validó una vez más mediante las Herramientas del IPT antes del proceso de publicación.","methodSteps":["Preparación y planeación para los diferentes componentes a muestrear incluyó condiciones climáticas y oceanográficas; así como la ejecución de reuniones de información sobre los lugares a visitar, las actividades a completar, los encargados y líderes de cada componente asignado, roles, objetivos y condiciones seguras para realizar los muestreos en cada ecosistema.","Muestreo en ecosistemas estratégicos - Manglar. Muestreo 1: recorridos mediante caminatas a través del manglar en marea baja, con duración entre 3 y 6 horas (dependiendo del área), durante los cuales se realizaban búsquedas intensivas y se recolectaban manualmente especímenes de invertebrados y plantas asociados al ecosistema. Etiquetado de campo. Muestreo 2: recolecta de peces asociados a raíces de mangle, mediante la instalación de red de atajo en la transición de la marea alta y baja, para posterior revisión y recolección de los peces. Etiquetado de campo.","Muestreo en ecosistemas estratégicos - Litoral rocoso. Búsqueda intensiva y recolecta manual de rocas sueltas con evidencia de organismos, mediante careteo o apnea en los lugares donde la profundidad del agua lo permitiera. Relajación con cloruro de magnesio (MgCl2) y cristales de mentol disueltos en agua de mar; preservación en alcohol al 96 %; etiquetado de campo.","Muestreo en ecosistemas estratégicos -  Planos lodosos intermareales. Muestreo 1: macrofauna muestreada directamente con 3 corazonadores de 16 cm de diámetro x 20 cm de profundidad en el supra, meso e infralitoral durante la marea baja. Relajación con cloruro de magnesio (MgCl2), fijación con formol al 10 % y preservación con alcohol al 96 %. Etiquetado de campo. Muestreo 2: avistamiento de aves playeras mediante recorrido de ida y vuelta a lo largo de la playa, realizando observaciones puntuales de los ejemplares, toma de fotografías, identificación y registro de los datos asociados.","Muestreo en ecosistemas estratégicos - Arrecife rocoso (riscal). Reunión preoperativa de seguridad y alistamiento del equipo de buceo para inmersión. Búsqueda intensiva in situ de los organismos durante 1 hora de buceo, recolecta manual de especímenes; relajación con cloruro de magnesio - MgCl2, fijación con formol al 10 % y preservación con alcohol al 96 %. Etiquetado de campo. Registro de ocurrencias. Toma de fotografías cuando era posible.","Muestreo en ecosistemas estratégicos - Ambiente pelágico. Muestreo 1: recolecta de peces pelágicos obtenidos mediante pesca con línea de mano y troleo. Fotografía de especímenes, preservación de tejidos en alcohol al 96 %, registro de datos asociados y etiquetado de campo. Muestreo 2: censo visual de aves mamíferos y reptiles durante el desplazamiento (muestreo de oportunidad), registro de observaciones entre 6 am y 6 pm, con intervalo de una hora de descanso. Fotografías y registro de información. Muestreo 3: toma de plancton mediante arrastre superficial horizontal durante 10 minutos, con red de poro de malla de 20, 200 y 500 micras, con flujómetro en la boca de la red. Fijación y preservación con formol al 4 %, neutralizado con borax; etiquetado de campo. Registro de datos asociados.","Separación, fijación, preservación y etiquetado de los especímenes y muestras. Las muestras obtenidas en los diferentes muestreos fueron trasladadas al barco, inventariadas y agrupadas por grupos taxonómicos. Cada ejemplar se fotografió y se le extrajeron tres (3) réplicas de tejidos para posteriores análisis moleculares. Los tejidos se tomaron de estructuras no diagnósticas para evitar alterar sus caracteres morfológicos. Los tejidos fueron etiquetados y con el fin de garantizar la viabilidad del ADN, se les realizaron recambios de etanol absoluto periódicos hasta llegar al laboratorio para su análisis. Finalmente, cada ejemplar se etiquetó y almacenó en bolsas, para su posterior análisis por taxonomía morfológica.","Identificación taxonómica. Las muestras fueron examinadas por expertos utilizando métodos morfológicos estandarizados en el laboratorio para observación de alta resolución, centrados en las estructuras morfológicas clave para la identificación específica; se usaron claves especializadas, catálogos y bases de referencia regional (Terborgh and Winter 1982, Andrade 1993, Fischer et al. 1995, Myers et al. 2000, Hooper and Van Soest 2002, Brusca and Brusca 2003, Londoño-Cruz et al. 2011, Alzate et al. 2014, Zea et al. 2014, Chasqui et al. 2017, Lizarazo et al. 2020, Mejía-Quintero and Chasqui 2020, Mejía-Quintero et al. 2021, Robertson and Allen 2024, de Voogd et al. 2025). Las muestras infaunales se volvieron a lavar para eliminar los sedimentos finos, se clasificaron en taxones principales (Annelida, Arthropoda, Mollusca, Echinodermata) y se conservaron en etanol al 96 %. Se realizó una documentación fotográfica a lo largo de todo el proceso utilizando cámaras digitales, estereomicroscopios y microscopios ópticos (Zeiss Axio Lab. A1, Primo Star; Leica S6 D; Zeiss Axiocam ERc 5s). Las mediciones de las estructuras clave se realizaron con ZEN Lite Blue 2.1 y el software LAS Leica. Las identificaciones se llevaron hasta el nivel taxonómico más bajo posible, principalmente a especie, y se asignaron morfotipos cuando la morfología no era concluyente. Se realizó caracterización molecular mediante códigos de barras del ADN, usando para la amplificación cebadores específicos para los genes COI, 16S, 12S y 28S por grupo taxonómico y siguiendo protocolos estandarizados por el INVEMAR; la secuenciación se realizó con tecnología Sanger. Los análisis bioinformáticos incluyeron la purificación y alineación de secuencias forward y reverse y la obtención de consensos de mas de 500pb y cromatogramas curados, así como análisis de brechas para evaluar la variación genética entre especies y dentro de ellas. Las secuencias obtenidas se compararon con las bases de datos genéticas disponibles en GeneBank y BoldSystems, se realizaron las asignaciones a especie por encima del 99% de identidad, a género por encima del 98%, y en categorías superiores, a las secuencias que no tuvieran coincidencias que cumplieran con estos criterios.","Validación de expertos: los resultados moleculares se compararon con las identificaciones morfológicas realizadas por expertos taxónomos, específicamente para los filos Annelida, Crustacea, Echinodermata, Mollusca, Platyhelminthes y Chordata (peces). En los casos donde se presentaron discrepancias entre los enfoques molecular y morfológico, el taxónomo establecía la asignación definitiva con base en su criterio experto. Durante la validación, para las secuencias nuevas de especies que no estaban registradas en las bases de datos se crearon los registros correspondientes.","Estructuración de datos e información: se construyeron dos tablas en formatos Excel, una de ocurrencias con los datos de presencia de especies basados en registros de especímenes, observaciones y avistamientos. La otra contenía datos sobre variables complementarias registradas en relación con el sexo, la etapa de vida, el recuento individual y los comportamientos (conocida como extensión ampliada de medidas o hechos - eMoF). Ambas tablas estructuradas acorde al estándar Darwin Core y a los lineamientos establecidos por SIBM - OBIS Colombia para la publicación de datos marinos. Para los registros con información molecular, también se procedió a la documentación directa en la plataforma de BOLDSystems. El identificador \"ProcessId\" generado por BOLD fue usado para asociar la secuencia a la tabla de datos de los registros, junto con el enlace de acceso respectivo.","Elaboración y sistematización de metadatos en IPT. Se efectuó la documentación de la información del proyecto, entidades y personas participantes, fuentes de financiación, cobertura temporal, taxonómica y geográfica, autores, referencias bibliográficas y demás datos que ayudan a enriquecer el contexto del conjunto de datos. Se realizó la validación de campos contra estándar para metadatos EML dentro de la plataforma IPT.","Documentación y sistematización de información molecular. La información de las secuencias obtenidas se almacenó en BOLDSystems dentro del contenedor CCBIO de Minciencias Colombia - Bio. Todos los datos y metadatos se documentaron de acuerdo con las directrices de este sistema.","Controles de calidad de datos y publicación. Se tuvieron en cuenta cuatro criterios: curatoriales (verificación física de lotes e información), taxonómicos (validaciones taxonómicas), espaciales (validaciones de georreferenciación), y documentales. La estandarización acorde a DwC, siguiendo los lineamientos nacionales para datos marinos y costeros del SiBM - OBiS Colombia y SiB Colombia, y los criterios requeridos por los sistemas globales (OBiS y GBIF). Se utilizaron las siguientes herramientas para optimizar los procesos de control de calidad durante la aplicación de cada criterio: Aspectos taxonómicos: Worms match taxa (https://www.marinespecies.org), Schmeyer´s Catalog of fishes of California Academy of Sciences https://www.calacademy.org/scientists/projects/eschmeyers-catalog-of-fishes, The World Porifera Database (https://www.marinespecies.org/porifera/). Aspectos espaciales: https://data.canadensys.net/tools/coordinates, OBIS maptools (https://obis.shinyapps.io/coordinates/), Marine Regions Gazeteer https://www.marineregions.org/gazetteer.php?p=search, Google Earth Pro 2022 version 7.3.6.9345, Codificación de la división político-administrativa de Colombia - Divipola (https://geoportal.dane.gov.co/geovisores/territorio/consultadivipola-division-politico-administrativa-de-colombia/). Vocabularios controlados: The NERC Vocabulary Server (https://vocab.nerc.ac.uk/collection), OBIS Measurement Types (https://mof.obis.org/).  Validaciones: GBIF Data Validator (https://www.gbif.org/es/tools/data-validator), Elementos obligatorios para los registros marinos: plantilla para la publicación de datos sobre biodiversidad de Colombia. OBIS Quality checks (https://github.com/iobis/obis-qc/), GBIF Data quality requirements: Occurrence datasets (https://www.gbif.org/data-quality-requirements-occurrences).","Publicación del recurso en OBIS y GBIF: paso realizado por el Nodo OBIS Colombia para la verificación de la lista de chequeo de banderas de calidad de OBIS y GBIF, el mapeo del recurso (datos y metadatos) en el IPT, asignación del DOI, registro en GBIF, y publicación de un solo paso en SIBM, SIB, OBIS y GBIF.","Depósito en colecciones científicas. Los ejemplares y muestras obtenidas con la expedición fueron catalogados y almacenados en las siguientes colecciones científicas: Museo de Historia Natural Marina de Colombia Makuriwa - MHNMC (Invemar);  Colección Hidrobiológica del Chocó - CHbCh (Universidad Tecnológica del Chocó); y en las Colecciones de referencia de la Universidad del Valle. Cada colección emitió certificados de depósito para proporcionar prueba oficial del cumplimiento de las regulaciones nacionales."]},"countryCoverage":[],"collections":[{"name":"Museo de Historia Natural Marina de Colombia","specimenPreservationMethod":"ALCOHOL","curatorialUnits":[{"typeVerbatim":"Registros biológicos de especimenes","count":0,"deviation":0,"lower":1,"upper":1302},{"typeVerbatim":"Registros biológicos de observaciones","count":0,"deviation":0,"lower":1,"upper":805}]},{"name":"Colección Hidrobiológica de la Universidad Tecnológica del Chocó","curatorialUnits":[]},{"name":"Colecciones de Referencia de Biología Marina de la Universidad del Valle","curatorialUnits":[]}],"dataDescriptions":[],"dataLanguage":"spa","acknowledgements":"Este trabajo fue realizado con el aporte de numerosas personas y entidades. Agradecemos especialmente al Colectivo del Consejo Comunitario General “Los Delfines” (CCG Los Delfines) y al Consejo Comunitario de Cupica, por su participación durante la preparación y ejecución de la expedición. A la empresa Mar Antiguo y la tripulación del barco Andrea Paola. A los pasantes, estudiantes, investigadores, profesionales y técnicos de las entidades científicas involucradas en la expedición, procesamiento y análisis biológico, y a sus instituciones participantes: Universidad del Valle (Programa de Biología), Universidad Tecnológica del Chocó (Programa de Biología), e Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras INVEMAR (Museo de Historia Natural Marina de Colombia Makuriwa - MHNMC y Programa de Biodiversidad y Ecosistemas Marinos). Así mismo y por su respaldo al proyecto en la región, a las demás entidades socias: BIOINNOVA Centro Nacional de Ciencia, Tecnología e Innovación para el desarrollo productivo sostenible de la biodiversidad e Instituto de Investigaciones Ambientales del Pacífico \"Federico Von Neumann\" - IIAP.  Al financiador principal, el Ministerio de Ciencia, Tecnología e Innovación - Minciencias y su Programa Colombia Bio. \n\nEste trabajo fue efectuado mediante el Contrato de Financiamiento de Recuperación Contingente No. 112721-421-2023,\ncelebrado entre Fiduciaria Colombiana de Comercio Exterior S.A. – Fiducoldex, actuando como vocera y administradora del Fondo Nacional de Financiamiento para la Ciencia, la Tecnología y la Innovación - Fondo Francisco José de Caldas, y el Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras “José Benito Vives de Andréis” - INVEMAR.","pubDate":"2026-07-02T00:00:00.000+00:00","maintenanceUpdateFrequency":"AS_NEEDED","maintenanceDescription":"","license":"http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/legalcode","dwca":{"coreType":"http://rs.tdwg.org/dwc/terms/Occurrence","extensions":["http://rs.iobis.org/obis/terms/ExtendedMeasurementOrFact"],"modified":"2026-07-02T19:29:17.216+00:00"},"approximateCounts":{"occurrenceCount":2107}}