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Las accesiones silvestres, en especial, pueden contener microorganismos con propiedades superiores debido a su coevolución con ambientes naturales diversos.\n\nMaterial vegetal: Se seleccionaron 3 cultivares comerciales y 5 accesiones silvestres con diferentes niveles de resistencia reportada a Fol. Las plantas se cultivaron con y sin enmienda orgánica para evaluar el efecto de esta condición en la colonización y diversidad endófita. Se utilizaron raíces y tallos como fuentes de endófitos.\n\nAislamiento de endófitos: Los tejidos fueron sometidos a desinfección superficial rigurosa y posteriormente macerados en condiciones estériles. Las suspensiones se sembraron en medios no selectivos para recuperar una amplia diversidad bacteriana. Se obtuvieron 106 aislados endófitos, los cuales fueron purificados, codificados y conservados para su evaluación.\n\nCaracterización funcional: Cada aislado fue sometido a pruebas para determinar su potencial de biocontrol y promoción del crecimiento vegetal:\n1. Producción de proteasas: Los aislados se evaluaron en medio con caseína\n2. Producción de HCN (cianuro de hidrógeno): Se empleó un método colorimétrico con papel impregnadp en ácido pícrico.\n3. Producción de AIA (ácido indolacético): Se incubaron en medio con triptófano y se reveló con reactivo de Salkowski.\n4. Producción de sideróforos: Se usó el método CAS.\n\nAntagonismo contra Fusarium oxysporum: Se evaluaron 51 aislados en confrontación dual con Fol, para evaluar las tasas de inhibición del crecimiento fúngico, \n\nSitio de desarrollo del proyecto: El estudio fue realizado en tres sedes de Agrosavia:\nCentro de Investigación La Selva – Rionegro, Antioquia\nCentro de Investigación La Libertad – Villavicencio, Meta\nCentro de Investigación Tibaitatá – Mosquera, Cundinamarca","relatedProjects":[],"abstract":"El objetivo de este estudio fue aislar bacterias endófitas con la capacidad de inhibir el crecimiento de Fol. Tallos y raíces de 3 cultivares comerciales y 5 accesiones silvestres resistentes o susceptibles a Fol, cultivados en presencia o ausencia de enmienda orgánica, fueron utilizados como fuentes de endófitos.\nUsando un enfoque de culturomics se obtuvieron 106 aislados endófitos. Entre ellos, 51 inhibieron el crecimiento de Fol, 74 produjeron proteasas, 63 fueron positivos para producción de cianuro de hidrógeno (HCN), y 18 sintetizaron ácido indolacético (IAA). Ninguno de los aislados produjo sideróforos."},"samplingDescription":{"studyExtent":"Para este estudio se utilizaron plantas de tres accesiones resistentes a Fusarium oxysporum f.s lycopersici (Fol) de S. pimpinellifolium y una de L. sculetum var, cerasiforme del Banco de Germoplasma de la Nación (BGN), así como plantas de dos cultivares comerciales resistentes a Fol comúnmente utilizados por productores de tomate de la región andina, Roble y Libertador, y el cultivar susceptible Santa Cruz Kada.  Desarrollado en los centros de investigación (C.I.) La libertad, C.I. Tibaitatá y C.I. La Selva de AGROSAVIA.","sampling":"Se utilizaron de 6 a10 plantas de cada accesión para formar una muestra compuesta en el aislamiento de endófitos de tallo y raíz en tres medios de cultivo después de 21 días de inoculación con Fol (French et al, 2020; Manzotti et al, 2020; Upreti and Thomas, 2015; Tian et al, 2017; Nawangsih et al, 2011).","methodSteps":["Medios de cultivo: El primer medio de cultivo fue el medio mínimo (MMF) diluido al 10% descrito por Robertsen et al., (1981) suplementado con masa celular muerta de Fol a una concentración del 1%\nEl segundo medio al que se denominó medio tomate (MT) estuvo compuesto por extracto de tallo de tomate al 1% y fitoagar al 1.8% \nEl tercer medio fue agar nutritivo diluido 10 veces.","Aislamientos: Los aislamientos se realizaron de acuerdo con el protocolo de Kusunoki y colaboradores (2012). Brevemente, una muestra compuesta de cada accesión será desinfectada con hipoclorito de sodio al 2% durante 15 minutos, seguido de un lavado en etanol al 70% por un minuto y finalizando con tres lavados con agua destilada estéril. Las hojas se retiraron para descarte y procesaron los tallos y las raíces por separado. El tejido vegetal fue pesado y macerado en 10 veces el volumen de buffer fosfato estéril pH 7.0. A partir del macerado se realizaron diluciones seriadas 1/10 con buffer fosfato y se sembrarán en los medios previamente descritos. Adicionalmente, veinte microlitros del macerado sin diluir se sembraron en 180µL de los medios líquidos en placas de 96 pozos, en cinco réplicas, y diluidos en pozos subsecuentes hasta una dilución 1/10000.","Incubación: Los medios fueron incubados por 15 días y los pozos con crecimiento fueron recuperados en medios sólidos. Se recuperaron UFC de los medios sólidos para su purificación.\nCaracterización funcional:\n1. Producción de proteasas: Los aislados se sembraron en un medio con caseína y se incubaron 48–72 h.\nLa presencia de halos claros alrededor del crecimiento se registró como indicativo de actividad proteolítica.\n2. Producción de HCN (cianuro de hidrógeno): Las bacterias se cultivaron en un medio con glicina y se expusieron a papel impregnado con ácido pícrico. El cambio de color del papel indicó producción positiva de HCN.\n3. Producción de AIA (ácido indolacético): Los aislados crecieron en caldo con triptófano y se revelaron con reactivo de Salkowski. La formación de color rosado se interpretó como síntesis de AIA.\n4. Producción de sideróforos: Se sembraron en medio CAS para detectar halos naranjas asociados a captura de hierro. \n5. Antagonismo contra Fusarium oxysporum: Se realizó confrontación dual en PDA entre cada aislado y Fol.\nLa inhibición del crecimiento fúngico se clasificó como alta, media o baja.","Identificación molecular: de los aislados endófitos seleccionados se realizó mediante la amplificación y secuenciación del gen 16S rRNA, usando un protocolo estándar adaptado para bacterias endofíticas; para ello, se seleccionaron 26 aislados con mejores resultados funcionales (antagonistas y productores de AIA). Se extrajo ADN genómico de los aislados seleccionados usando el Kit comercial y se verificó su calidad por electroforesis en gel. El gen 16S rRNA se amplificó mediante PCR con los primers universales 27F/1492R, obteniéndose un fragmento único de ~1.4 kb. Los productos fueron enviados para secuenciación Sanger. Las secuencias se analizarán mediante evaluación de calidad (FinchTV), ensamblaje (CAP3), comparación por BLAST con GenBank (>95% identidad) y análisis filogenético con MUSCLE y Neighbor-Joining."]},"countryCoverage":[],"collections":[],"dataDescriptions":[],"dataLanguage":"spa","acknowledgements":"Agradecimientos al financiador a través de la convocatoria Bayer Crop: Protección sostenible de cultivos y preservación de hábitats naturales de 2021. Agradecimiento especial al equipo de investigadores de AGROSAVIA, Luis Lizarazo y Xiomara Abella del Centro de Investigación La Libertad por su ayuda en el desarrollo de este estudio. Agradecimiento a Andrea Paola Zuluaga del Centro de Investigación Tibaitata por proporcionar ADN de R. solanacearum, para este estudio.","pubDate":"2025-12-05T00:00:00.000+00:00","maintenanceUpdateFrequency":"AS_NEEDED","maintenanceDescription":"Conservación mediante criopreservación de una mezcla protectora compuesta por glicerol al 10 % (v/v), peptona al 0,1 % (p/v) y leche descremada al 10 % (v/v). Se  prepara una solución estéril de estos componentes y se mezcla con los cultivos bacterianos frescos (18–24 h) en tubos criogénicos estériles en una proporción aproximada de 1:9 (cultivo:crioprotector). Los tubos se mezclan suavemente py se congelan directamente a -20 °C para colección de trabajo y –80 °C para almacenamiento a largo plazo. La recuperación se realiza tomando el material congelado sin descongelar completamente el vial y siembra en medio de cultivo sólido fresco y reincubando la cepa bajo condiciones estándar.","license":"http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/legalcode","dwca":{"coreType":"http://rs.tdwg.org/dwc/terms/Occurrence","extensions":["http://data.ggbn.org/schemas/ggbn/terms/Permit"],"modified":"2026-10-19T02:37:00.841+00:00"},"approximateCounts":{"occurrenceCount":106}}