{"key":"89e51c83-12e2-4ad3-a748-e5603266c52b","installationKey":"68845aab-a453-4816-b36d-a3ec8455deb0","publishingOrganizationKey":"488f6b87-5688-4c9a-928c-2d5355054b01","doi":"10.15472/vu4x8d","version":"2.1","external":false,"numConstituents":0,"type":"OCCURRENCE","subtype":"OBSERVATION","title":"Registro de microorganismos asociados a la Cebolla de rama (Allium spp.) obtenidos de material de propagación colectado en diferentes zonas de Colombia y otros provenientes del Banco de Germoplasma Vegetal","description":"\n            Microorganismos asociados a la especie vegetal Cebolla de rama - Allium spp. producto de una actividad de colecta de material de propagación y suelo en diferentes zonas de Colombia - dentro del Proyecto - Mejoramiento del sistema productivo de Cebolla de Rama enfocado a las demandas del mercado en fresco y/o agroindustria en el departamento de Antioquia. Este registro corresponde a los especímenes seleccionados e identificados con relación a los aislamientos de Bacterias Promotoras de Crecimiento Vegetal - BPCV y consorcios de Hongos Formadores de Micorrizas Arbusculares - HFMA más eficientes en cebolla de rama Allium spp. También, a microorganismos asociados a la especie vegetal causantes de enfermedades.\n\nEste conjunto de datos consta de 90 registros biológicos identificados a nivel de especie.\n        ","language":"spa","logoUrl":"https://gitlab.com/sib-colombia/logos/-/raw/main/socio-SiB-agrosavia.png","citation":{"text":"Martínez Lemus E P, Grisales Vásquez N Y, Camelo Rusinque M, Serralde Ordóñez D P, Wilches Ortíz W A, Hío Perdomo J C, Ballestas Álvarez K L, Carrero Gutiérrez M L, Sepúlveda Ortega S M, Bedoya Vélez G Y, Gómez Osorno C M, Aguilar Aguilar P A (2025). Registro de microorganismos asociados a la Cebolla de rama (Allium spp.) obtenidos de material de propagación colectado en diferentes zonas de Colombia y otros provenientes del Banco de Germoplasma Vegetal. Version 2.1. Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria - AGROSAVIA. 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Se identificaron cuatro órdenes, 11 familias, 17 géneros.","coverages":[{"scientificName":"Burkholderiales","rank":{"verbatim":"order","interpreted":"ORDER"}},{"scientificName":"Enterobacterales","rank":{"verbatim":"order","interpreted":"ORDER"}},{"scientificName":"Glomerales","rank":{"verbatim":"order","interpreted":"ORDER"}},{"scientificName":"Pseudomonadales","rank":{"verbatim":"order","interpreted":"ORDER"}}]}],"geographicCoverages":[{"description":"La actividad de colecta de Material Vegetal de Cebolla de Rama se realizó durante los años 2022 y 2023 en los departamentos de Antioquia, Boyacá, Caldas, Cundinamarca, Nariño, Norte de Santander, Risaralda, Santander y Valle del Cauca, conformando una colección de trabajo de 83 accesiones más 69 provenientes del Banco de Germoplasma Vegetal de Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria Agrosavia. En esta colección de trabajo, mediante monitoreos sanitarios y análisis de la rizósfera, se encontraron los especímenes acá reportados.","boundingBox":{"minLatitude":5.562528,"maxLatitude":6.67675,"minLongitude":-75.965694,"maxLongitude":-75.315083,"globalCoverage":false}}],"temporalCoverages":[{"@type":"range","start":"2022-07-11T00:00:00.000+00:00","end":"2023-08-21T00:00:00.000+00:00"}],"keywordCollections":[{"thesaurus":"N/A","keywords":["Hongos formadores de micorrizas arbusculares.","Allium spp.","Bacterias promotoras de crecimiento vegetal.","Pruebas de Evaluación Agronómica.","Colecta.","Microorganismos.","Cebolla de rama"]},{"thesaurus":"GBIF Dataset Type Vocabulary: http://rs.gbif.org/vocabulary/gbif/dataset_type_2015-07-10.xml","keywords":["Occurrence"]},{"thesaurus":"GBIF Dataset Subtype Vocabulary: http://rs.gbif.org/vocabulary/gbif/dataset_subtype.xml","keywords":["Observation"]}],"project":{"title":"Mejoramiento del sistema productivo de cebolla de rama enfocado a las demandas del mercado en fresco y/o agroindustria en el departamento de Antioquia.","contacts":[{"type":"PRINCIPAL_INVESTIGATOR","primary":false,"userId":[],"firstName":"Paula Andrea","lastName":"Aguilar Aguilar","position":[],"email":[],"phone":[],"homepage":[],"address":[]}],"funding":"La fuente de financiación de este proyecto es el departamento de Antioquia con el tipo de recurso SGR - Asignación para la ciencia, \ntecnología e innovación - Convocatorias 2021.","awards":[],"relatedProjects":[],"abstract":"Dentro de la cadena productiva de Aliáceas en Colombia, los problemas limitantes del cultivo de la Cebolla de Rama son la falta de variedades mejoradas tolerantes a enfermedades y adaptadas a condiciones agroecológicas del productor y demandas del mercado, carencia de estudios fenológicos para determinar requerimientos nutricionales e hídricos, baja disponibilidad de material de siembra, por lo que este proyecto tiene como objetivo mejorar la productividad y sostenibilidad del sistema de Cebolla de Rama en el departamento de Antioquia, con la selección de genotipos adaptados de acuerdo con las demandas del mercado en fresco y/o con atributos para la agroindustria y la generación de recomendaciones tecnológicas para su manejo. El proyecto consta de seis componentes interrelacionados que pretenden responder a dichos problemas y generar respuestas específicas mediante la generación de nuevo conocimiento y al aprovechamiento de oportunidades del territorio antioqueño. Dichos componentes son:\n1. Análisis económico y de mercado para el sistema productivo de cebolla de rama en la Región Andina. 2. Colecta, identificación, selección, multiplicación y evaluación de materiales de cebolla de rama en el departamento de Antioquia 3. Manejo agronómico del cultivo, 4. Producción de semilla de cebolla de rama con características de calidad genética y fitosanitaria, 5. Postcosecha y \nagroindustria 6. Validación del modelo productivo del cultivo de cebolla de Rama. El proyecto iniciaría con un análisis de mercado e identificación de la cadena de valor del cultivo y levantamiento de tecnología local de producción, colectas de diferentes genotipos de cebolla de rama en el departamento de Antioquia y otros departamentos del país, caracterización genotípica y fenotípica e identificación de genotipos para el departamento, seguido de evaluaciones de requerimientos nutricionales e hídricos, producción de semilla de calidad, postcosecha, generación de valor agregado y vocaciones de uso de los materiales y validación de las prácticas y recomendaciones desarrolladas a lo largo del proyecto, para obtener así variedades adaptadas a cada una de las regiones priorizadas, con sus respectivas recomendaciones técnicas y potenciales de uso de dichos materiales, que permitan ofrecer un modelo tecnológico para el departamento y una ventaja competitiva para dicho sistema tecnológico a nivel nacional e internacional."},"samplingDescription":{"studyExtent":"Municipios con historial de producción de cebolla de rama en Colombia, de los departamentos de Antioquia, Boyacá, Caldas, Cundinamarca, Nariño, Norte de Santander, Risaralda, Santander y Valle del Cauca,","sampling":"Se identificaron predios productores de cebolla de rama y se tomaron muestras de material vegetal sano con fines de propagación; también con síntomas asociados a infecciones para diagnóstico de enfermedades. Las plantas con síntomas de pudriciones bacteriales se llevaron al laboratorio y se aislaron en cultivo Agar Nutritivo AN.\nEn el sitio de muestreo del material vegetal también se tomaron aproximadamente 500 gramos de suelo para aislamiento de hongos formadores de micorrizas arbuscular (HFMA) y 200 gramos de suelo rizosférico y colecta de plantas completas para aislamiento de microorganismos con potencial capacidad para promover el crecimiento vegetal en cultivos de esta especie. En laboratorio, en el caso de los Hongos Formadores de Micorrizas Arbusculares, se llevó a cabo una decantación húmeda de lavado de muestras de suelo, se realizó una suspensión en solución de sacarosa que permitiera la extracción de esporas del hongo, las cuales se cuantificaron por cada punto de muestreo; para el aislamiento de bacterias promotoras de crecimiento vegetal se llevó a cabo una desinfección superficial de material vegetal y luego macerado del material para realizar diluciones seriadas en solución salina 0.9% y se sembraron alicuotas de 100 microlitros en medio AN por triplicado. Adicionalmente, se tomaron 10 gr de suelo y se hicieron diluciones seriadas de 10-1 a 10-6, las diluciones 10-4, 10-5 y 10-6 fueron sembradas en medios de cultivo para microorganismos solubilizadores de fósforo y fijadores de nitrógeno.","methodSteps":["Las plantas con síntomas de pudriciones bacteriales se llevaron al laboratorio y se aislaron en cultivo agar nutritivo AN.","Identificación morfológica (microscópica, características de crecimiento en medios de cultivos específicos), identificación bioquímica a través de batería API (20NE y RApiID32) y bioensayos en huéspedes no blanco (licuefacción de tubérculos de papa). Estandarización de los protocolos de extracción de ADN, amplificación por PCR con primer´s específicos y generales (16S) y secuenciación para identificación a nivel de especie.","En el caso de los Hongos Formadores de Micorrizas Arbusculares HFMA fueron caracterizados por sus características morfológicas y agrupados para la consolidación de consorcios.","Selección de los consorcios o cepas de mayor interés y potencial.","Identificación taxonómica detallada de los géneros y/o especies presentantes en el/los inóculos con potencial biofertilizante.","Aislamiento de bacterias promotoras de crecimiento vegetal (BPCV), utilizando la técnica de dilución y recuento en placa con medios específicos de crecimiento para determinar por morfología su identificación a nivel de género.","Pruebas para determinación de microorganismos solubilizadores de fosfato.","Seleccionados e identificados con relación a los aislamientos de Bacterias Promotoras de Crecimiento Vegetal - BPCV y consorcios de Hongos Formadores de Micorrizas Arbusculares - HFMA más eficientes.","Para los HFMA se realizó identificación morfológica a partir de esporas registrándose las morfoespecies más abundantes de cada muestra.","Para las BPCV se realizó la amplificación del gen 16S rADN con los primers universales de bacteria 27F (5’-AGAGTTTGATCMTGGCTCAG-3’) y 1492R (5’-GGTTACCTTGTTACGACTT-3’)."]},"countryCoverage":[],"collections":[],"dataDescriptions":[],"dataLanguage":"spa","acknowledgements":"<p>El desarrollo del proyecto \"Mejoramiento del sistema productivo de cebolla de rama enfocado a las demandas del mercado en \nfresco y/o agroindustria en el departamento de Antioquia\" fue gracias a la cooperación financiera de la Gobernación de Antioquia a través de las secretarías de Agricultura y Desarrollo Rural; Competitividad y Productividad y al Sistema General de Regalías del Departamento. </p><p>La ejecución técnica se realizó en alianza con las Universidades EAFIT y Nacional de Colombia sede Bogotá, quienes participaron en el desarrollo de algunas actividades del proyecto.</p>","pubDate":"2025-10-23T00:00:00.000+00:00","maintenanceUpdateFrequency":"AS_NEEDED","maintenanceDescription":"La frecuencia de actualización de este registro se realizará cuando sea necesario ya que se continúa con los monitoreos en la colección de trabajo de cebolla de rama establecida como Pruebas Regionales y posteriormente como Pruebas de Evaluación Agronómica en cuatro regiones del departamento de Antioquia.","license":"http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/legalcode","dwca":{"coreType":"http://rs.tdwg.org/dwc/terms/Occurrence","extensions":["http://data.ggbn.org/schemas/ggbn/terms/Permit"],"modified":"2026-10-12T03:03:46.682+00:00"},"approximateCounts":{"occurrenceCount":90}}